MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 96961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019703	CAG	2	6	8	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
2	NC_019703	CTT	2	6	31	36	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223462
3	NC_019703	GCTACA	2	12	57	68	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428223462
4	NC_019703	GCC	2	6	74	79	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
5	NC_019703	CG	3	6	162	167	0 %	0 %	50 %	50 %	428223462
6	NC_019703	CAT	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223462
7	NC_019703	CGCCAG	2	12	270	281	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	428223462
8	NC_019703	CGA	2	6	282	287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
9	NC_019703	GCC	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
10	NC_019703	CCG	3	9	337	345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
11	NC_019703	TCG	3	9	410	418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223462
12	NC_019703	CAA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223462
13	NC_019703	CGC	2	6	441	446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
14	NC_019703	CGGG	2	8	471	478	0 %	0 %	75 %	25 %	428223462
15	NC_019703	GCG	3	9	500	508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223462
16	NC_019703	CGC	2	6	621	626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
17	NC_019703	CCG	2	6	630	635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
18	NC_019703	CTG	2	6	682	687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223462
19	NC_019703	CGA	2	6	690	695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
20	NC_019703	AGT	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223462
21	NC_019703	GACC	2	8	793	800	25 %	0 %	25 %	50 %	428223462
22	NC_019703	AGA	2	6	908	913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223462
23	NC_019703	GCCT	2	8	935	942	0 %	25 %	25 %	50 %	428223462
24	NC_019703	ACA	2	6	1058	1063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223462
25	NC_019703	AAG	3	9	1087	1095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223462
26	NC_019703	GCC	2	6	1132	1137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223462
27	NC_019703	GC	3	6	1198	1203	0 %	0 %	50 %	50 %	428223462
28	NC_019703	AC	3	6	1230	1235	50 %	0 %	0 %	50 %	428223462
29	NC_019703	GAGCT	2	10	1237	1246	20 %	20 %	40 %	20 %	428223462
30	NC_019703	GAA	2	6	1261	1266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223462
31	NC_019703	GGC	2	6	1270	1275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223462
32	NC_019703	ACG	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223462
33	NC_019703	AAC	2	6	1405	1410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223462
34	NC_019703	AGC	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019703	GCT	2	6	1472	1477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019703	TGC	2	6	1480	1485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019703	TCA	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019703	ATTT	2	8	1652	1659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019703	CTA	3	9	1881	1889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019703	TTTAAA	2	12	1893	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019703	AGT	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019703	TCCGA	2	10	2009	2018	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_019703	AGC	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019703	A	6	6	2036	2041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019703	CGAT	2	8	2052	2059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019703	A	6	6	2107	2112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019703	AAGC	2	8	2134	2141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019703	A	6	6	2149	2154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019703	AAGC	2	8	2176	2183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019703	A	6	6	2191	2196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019703	TCCGA	2	10	2220	2229	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_019703	ATCCG	2	10	2231	2240	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_019703	AGC	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019703	A	8	8	2259	2266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019703	A	8	8	2306	2313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019703	T	6	6	2477	2482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019703	GTTT	2	8	2512	2519	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019703	T	6	6	2517	2522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019703	A	6	6	2524	2529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019703	T	7	7	2603	2609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019703	GTT	2	6	2627	2632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019703	GAA	2	6	2651	2656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019703	T	6	6	2658	2663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019703	GCA	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019703	AGC	2	6	2853	2858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019703	A	7	7	2922	2928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019703	CTT	2	6	3010	3015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223463
68	NC_019703	CGA	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223463
69	NC_019703	CTT	2	6	3037	3042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223463
70	NC_019703	GC	3	6	3087	3092	0 %	0 %	50 %	50 %	428223463
71	NC_019703	ATG	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223463
72	NC_019703	CTT	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019703	GC	3	6	3373	3378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019703	AAG	2	6	3416	3421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019703	CTG	2	6	3481	3486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019703	TTG	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223464
77	NC_019703	AAG	2	6	3619	3624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223464
78	NC_019703	CGC	2	6	3758	3763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223464
79	NC_019703	CGG	2	6	3817	3822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223464
80	NC_019703	AGA	2	6	3833	3838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223464
81	NC_019703	CCAAG	2	10	3938	3947	40 %	0 %	20 %	40 %	428223464
82	NC_019703	ACG	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223464
83	NC_019703	ACG	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223464
84	NC_019703	CTGC	2	8	4129	4136	0 %	25 %	25 %	50 %	428223464
85	NC_019703	TGG	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223464
86	NC_019703	TCA	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223464
87	NC_019703	CAT	2	6	4187	4192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223464
88	NC_019703	GCT	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223464
89	NC_019703	CGT	2	6	4211	4216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223464
90	NC_019703	GAC	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223464
91	NC_019703	TCAA	2	8	4563	4570	50 %	25 %	0 %	25 %	428223465
92	NC_019703	CAC	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223465
93	NC_019703	AAT	2	6	4649	4654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223465
94	NC_019703	TCAA	2	8	4767	4774	50 %	25 %	0 %	25 %	428223465
95	NC_019703	TGG	2	6	4840	4845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223465
96	NC_019703	GA	3	6	4935	4940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019703	TGC	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019703	CTG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223466
99	NC_019703	AGCA	2	8	5111	5118	50 %	0 %	25 %	25 %	428223466
100	NC_019703	GTTG	2	8	5148	5155	0 %	50 %	50 %	0 %	428223466
101	NC_019703	CAT	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223466
102	NC_019703	AGC	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019703	GAG	2	6	5349	5354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019703	ATG	2	6	5374	5379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019703	CGG	2	6	5624	5629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
106	NC_019703	GGC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
107	NC_019703	CAA	2	6	5661	5666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223467
108	NC_019703	AAG	2	6	5686	5691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223467
109	NC_019703	CTA	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223467
110	NC_019703	CGG	2	6	5700	5705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
111	NC_019703	ATCG	2	8	5740	5747	25 %	25 %	25 %	25 %	428223467
112	NC_019703	AGC	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
113	NC_019703	GCT	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
114	NC_019703	AGC	2	6	5960	5965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
115	NC_019703	GCA	2	6	5997	6002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
116	NC_019703	GCT	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
117	NC_019703	CTG	2	6	6097	6102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
118	NC_019703	CGT	2	6	6171	6176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
119	NC_019703	CAC	3	9	6177	6185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223467
120	NC_019703	GGC	2	6	6214	6219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
121	NC_019703	AGC	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
122	NC_019703	GGC	2	6	6396	6401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
123	NC_019703	GC	3	6	6400	6405	0 %	0 %	50 %	50 %	428223467
124	NC_019703	CGG	2	6	6435	6440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223467
125	NC_019703	ACC	2	6	6449	6454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223467
126	NC_019703	TGG	2	6	6461	6466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223467
127	NC_019703	CAA	2	6	6534	6539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223467
128	NC_019703	ACC	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223467
129	NC_019703	GAC	2	6	6627	6632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223467
130	NC_019703	CAT	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223467
131	NC_019703	CTG	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223467
132	NC_019703	GCC	2	6	6707	6712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223467
133	NC_019703	CCTCA	2	10	6751	6760	20 %	20 %	0 %	60 %	428223467
134	NC_019703	TGCC	2	8	6770	6777	0 %	25 %	25 %	50 %	428223467
135	NC_019703	TC	3	6	6956	6961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019703	CAG	2	6	6979	6984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019703	GTT	2	6	6998	7003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019703	GTA	2	6	7020	7025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019703	TTCA	2	8	7045	7052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019703	TCC	2	6	7054	7059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_019703	ATC	2	6	7089	7094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223468
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145	NC_019703	T	7	7	7239	7245	0 %	100 %	0 %	0 %	428223468
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155	NC_019703	AGCC	2	8	7643	7650	25 %	0 %	25 %	50 %	428223468
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195	NC_019703	TTGA	2	8	9502	9509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_019703	TCA	2	6	13177	13182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_019703	CAAT	2	8	13187	13194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
258	NC_019703	ACG	2	6	13237	13242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_019703	TCA	2	6	13280	13285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_019703	TGA	2	6	13308	13313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_019703	CCG	2	6	13405	13410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_019703	ATCA	2	8	13465	13472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
263	NC_019703	TTA	2	6	13533	13538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_019703	AAT	2	6	13539	13544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_019703	AAT	2	6	13562	13567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_019703	A	6	6	13574	13579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_019703	AAAG	2	8	13597	13604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
268	NC_019703	TCCT	2	8	13613	13620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
269	NC_019703	AGA	2	6	13626	13631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_019703	GGCA	2	8	13735	13742	25 %	0 %	50 %	25 %	428223476
271	NC_019703	CAG	2	6	13805	13810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223476
272	NC_019703	GGC	3	9	13811	13819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223476
273	NC_019703	CGG	2	6	13861	13866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223476
274	NC_019703	TCG	2	6	13947	13952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223476
275	NC_019703	GAT	2	6	13957	13962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223476
276	NC_019703	CTG	2	6	13982	13987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223476
277	NC_019703	CAA	2	6	14077	14082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_019703	TTTG	2	8	14131	14138	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
279	NC_019703	GGCTT	2	10	14158	14167	0 %	40 %	40 %	20 %	428223477
280	NC_019703	CGG	2	6	14207	14212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223477
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282	NC_019703	T	6	6	14255	14260	0 %	100 %	0 %	0 %	428223477
283	NC_019703	GGGTG	2	10	14261	14270	0 %	20 %	80 %	0 %	428223477
284	NC_019703	GGT	2	6	14271	14276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223477
285	NC_019703	GAGG	2	8	14286	14293	25 %	0 %	75 %	0 %	428223477
286	NC_019703	GCTCG	2	10	14321	14330	0 %	20 %	40 %	40 %	428223477
287	NC_019703	GCC	2	6	14340	14345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223477
288	NC_019703	AG	3	6	14438	14443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
289	NC_019703	AGCA	2	8	14449	14456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
290	NC_019703	CAG	2	6	14510	14515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_019703	ACC	2	6	14520	14525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_019703	G	6	6	14537	14542	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
293	NC_019703	GCGAG	2	10	14584	14593	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
294	NC_019703	TTCAG	2	10	14608	14617	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
295	NC_019703	CAA	2	6	14749	14754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223478
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298	NC_019703	CT	3	6	14954	14959	0 %	50 %	0 %	50 %	428223478
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303	NC_019703	GAACC	2	10	15122	15131	40 %	0 %	20 %	40 %	428223478
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331	NC_019703	TGG	2	6	15923	15928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
332	NC_019703	AAT	2	6	16089	16094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_019703	AGA	2	6	18665	18670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223482
398	NC_019703	AAG	2	6	18712	18717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223482
399	NC_019703	TG	3	6	18811	18816	0 %	50 %	50 %	0 %	428223482
400	NC_019703	CGC	2	6	18897	18902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223482
401	NC_019703	CGC	2	6	18921	18926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223482
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